随同行政改革方案，一些其它新政策也一同出台。

全面废除卫所制度，实行义务兵役征召制。

废除户籍等级制度，废除奴隶制度，废除妓籍、乐籍等贱民制度，废除教坊司，取消民户、灶户、军户、匠户等级分类。严禁人口买卖，实行居民户籍制度。

以家庭为单位，印制户口本，凡是年满6岁以上男女必须申领身份证，全面开展人口普查。

大明公民只要携带身份证和户口所在地新锦衣卫公安部出具的介绍信，可在大明地界任意流动、工作、生活。一年后，没有户口、身份证的人员将被作为黑户，送往矿场，进行劳动改造。

大明金融新政开始试行，天启2年后全国范围内强制流通使用中华银行新货币，政府收支全部采用中华银行新货币，不再收支旧货币。

中华银行为大明唯一合法金融机构，取缔私人钱庄，严厉查处民间非法铸造钱币。散碎金银、老旧货币限期至中华银行兑换成新货币，天启2年后禁止交易。

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废除盐、茶专卖制度，新设立烟草专卖。

天启2年起，漳州月港关停对外贸易，天津市、上海市、广州市、三亚市全面放开海禁，实行自由贸易。所有对外贸易由中华外贸统一掌控管理。

天津市、上海市、广州市、三亚市新锦衣卫税务部成立海关，征收关税。其它沿海各省筹建海关。各地海上巡逻队，加强稽查走私活动。

嘉峪关、榆林、大同、张家口、叶赫城、抚顺关、陇川宣抚司平麓城、孟艮府景栋、镇南关9地，集中设置大型互市，向叶尔羌、蒙古、女真、东吁、南掌、安南倾销各种大明制造的商品。

新锦衣卫税务部成立海关，征收关税。严控钢铁、粮食等战略物资流出，削弱敌人的战争潜力，大量进口粮油、牛羊马、奶酪、羊毛、木材、铜矿等商品。

随同行政改革和新政，人事制度、人事任用也进行大调整。人事制度建立人事编制、任职期限和退休制度。

鉴于大明旧有官僚体系仅有三部一院4家单位，各省市县最主要的工作为收取赋税，管理钱粮。省级行政单位人事编制官、吏约20人，市级单位官、吏约30人，县级单位官、吏约40人。每个省编制最多不超过4000人。

地方调整、裁撤的总督、巡抚、布政使、按察使等三品以上级别的官员回京城，接受吏部考核，根据考核结果另行分配工作。

地方调整、裁撤的其他官吏由新锦衣卫以集中组织学习培训的名义，进行整肃整编。经甄别审查，无违法犯罪行为的官吏，进行正式学习培训，经考核合格后，分配工作。

朝廷各七品以上岗位，原则上每5年一届，最多任职2届。每5年各岗位进行换届调整。地方一把手主官原则上不得在籍贯所在地任职。

凡是年满60岁的朝廷各级官吏，一律退休，安享晚年。退休工资按照工作时的工资标准的50%发放，直至过世。

地方各级政府原则上不得任用超过60岁的官吏，如有特殊人才，需要特别任用的，年龄可放宽至65岁，但必须报请内阁批准。

中央成立顾问部，对于超过60岁的特殊人才，朝廷又特别需要的，纳入顾问部，为国家大政方针出谋划策。年龄超限的，原则上不得担任一把手主官职务。